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- 부설연구소
- 3차원 국부 유동 및 세굴 실험, 수질 및 부영양화 실험,
내정온도 실험, 수치파동수로 실험,
해안선 변형 실험, 해빈류 실험, 항만 가동율 실험 등
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- 해양조사부
- 다층 해수유동 관측, 단측 해수유동 관측,
해빈류 관측 및 부표추적 실험 등
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- 환경화학생태부
- 수질, 저질조사, 육상오염원 조사,
유류오염사고 조사, 육상오염원 조사 등
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- 연안관리부
- 연안침식 실태조사,
실시간 이안류 관측 시스템,
연안재해 취약성 평가 체계 유지관리 등
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- 해양예보사업부
- 해양예보 시스템, 폭풍해일 및 범람 예측,
지진해일 예측, 해수유동 실험, 온배수확산 실험 등
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- 공간정보부
- 해저지형조사, 해저면영상탐사, 천부지층탐사, 해안선변동조사
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- 해양정보분석부
- 해양정보분석 등
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- 시스템개발부
- 실시간 기상/해양관측시스템,
무인이동 수환경모니터링시스템,
항로표지 원격관리시스템, 통합컨트롤러 등